醫院污水的性質指醫院產生的含有病原體、重金屬、消毒劑、有機溶劑、酸、堿以及放射性等的污水。醫院產生污水的主要部門和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動物房、同位素治療診斷、手術室等排水；醫院行政管理和醫務人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。
醫院污水來源及成分復雜，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化學污染物和放射性污染等，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染等特征，不經有效處理會成為一條疫病擴散的重要途徑和嚴重污染環境：
根據醫院的規模、性質和處理污水排放去向，進行工藝選擇。通常采用物化+生化方法處理，主要工藝有：絮凝沉淀(物化)+水解酸化(生化)+深度氧化(生化)+消毒---達標排放。絮凝沉淀(物化)+水解酸化(生化)+MBR(生化)+消毒--->達標排放。
醫院污水的消毒方式很多，如液氯法、臭氧法、次氯酸鈉法、二氧化氯法、紫外線消毒等。常用的消毒方法以二氧化氯法和氯化法為主。
